son una de las principales características de la evolución del genoma. Con vistas a las diferencias entre las secuencias de nucleótidos composición puede inducir a error serio reconstrucciones filogenéticas. Variación composicional grande existe entre los miembros de la familia de Drosophilidae. Hasta ahora, sin embargo, las diferencias de la composición base se han descuidado en gran medida en las formulaciones de la sustitución de nucleótidos proceso utilizado para reconstruir la filogenia de este importante grupo de especies. El presente estudio adopta un máximo de verosimilitud marco de la inferencia filogenética con el fin de analizar cinco regiones de genes nucleares y muestra que (1) el patrón de composicional variación en el Drosophilidae no coincide con la filogenia de la especie, (2) que representa el heterogéneo contenido de GC con Galtier y Gouy modelo de sustitución de nucleótidos lleva a un árbol que difiere en aspectos significativos del árbol inferirse cuando las diferencias en la composición de nucleótidos son ignoradas, a pesar de que ambas hipótesis filogenética lograr un fuerte apoyo nodal en los análisis de rutina de carga, y (3) la corrección de distancia LogDet no puede superar por completo los efectos distorsionadores de la variación composicional que existe entre las especies de la Drosophilidae. Nuestros análisis con confianza colocar el género Chymomyza como un grupo afuera más cerca que la Scaptodrosophila género al género Drosophila y contundente apoyo a la monofilia de la Sophophora subgénero. Introducción

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